上海美高双语学校小学1-5年级课程以上海市二期课改课标为纲，融合中美教育模式，课程设计分为基础型、拓展型和探究型，到了初中6-8年级，安排的课程更具有挑战性，科目的设置与小学相比较也更加的具体和有针对性。在高中阶段，上海美高双语学校安排的课程主要包括三大类：基础课程、AP课程、国际语言课程。

上海美高双语学校初中课程体系分为中学预备课程体系和高中预备课程体系设置。中学预备课程包括英语、数学、自然科学、社会人文、汉语、跨文化交流、艺术和体育八大模块。

上海美高双语学校小学课程设计是：课程设计分为基础型、拓展型和探究型。基础型课程以二期课改为准，强调掌握基础知识，为将来的学习夯实基础。培养目标是：全人教育目标，让孩子们养成良好的心理素质，塑造阳光心态。